Radi ostvarenja djelovanja Suda časti/Etičkog kodeksa te razvoja i primjene etičkih standarda, na Akademiji je osnovano radno tijelo Etičkog vijeća/Suda časti (u daljnjem tekstu: Etičko vijeće). Etičko vijeće donosi mišljenje i prijedlog o izricanju mjera za eventualnu povredu Etičkog kodeksa o načelnim pitanjima kao i o usklađenosti ponašanja u konkretnim slučajevima s načelima i odredbama Etičkog kodeksa.
Etičko vijeće utvrđuje odgovornost članova Akademije u slučaju nepoštivanja Statuta i drugih akata Akademije od strane članova svih oblika članstva, ali i drugih osoba koje nisu članovi Akademije, ali sudjeluju u radu i djelovanju Akademije, ako i ukoliko se ponašanje i djelovanje tih osoba može izravno povezati sa Akademijom.
Etičko vijeće ima Etički kodeks koji sadržava moralna načela i načela profesionalne etike kojima se u svom profesionalnom i javnom djelovanju trebaju ravnati članovi Bošnjačke akademije nauka i umjetnosti. Dati Kodeks se sastoji od standarda ponašanja prilagođenih potrebama Akademije i njenih Odjeljenja, uzimajući u obzir načela slobode naučnog i umjetničkog stvaralaštva te čuvanja dostojanstva i ugleda Akademije.
Svrha Etičkog kodeksa je promicanje vrijednosti specifičnih za djelatnost Akademije u najširem smislu. Promicanje etičnog ponašanja i vrijednosti koje su sadržane u ovom Kodeksu obveza je svih Odjeljenja, tijela i članova Akademije u cjelini.